В спорном деле 1689 года о земле Багаевского причта указаны в числе понятых крестьяне деревни Маркова и Богдарни.
В конце XIX — начале XX века село входило в состав Покров-Слободской волости Покровского уезда.
С 1929 года село являлось центром Марковского сельсовета Орехово-Зуевского района, в 1945—1960 годах село входило в Покровский район, с 1965 года — в составе Петушинского района.